10mメッシュ標高は1/25,000地形図の等高線データ等を基に作成したもので全国津々浦々が整備されています。
5mメッシュ標高は航空レーザ測量や写真測量によって作成したもので、都市部など一部が整備されています。

しかし、基盤地図情報で公開されているファイルは、JPGIS形式であるため、ArcGISで直接扱うことはできません。

そのために同ページで閲覧・変換ソフトが公開されているのですが、とても残念なことに、同ページにある基盤地図情報閲覧コンバートソフトは、数値標高モデルをシェイプファイルやラスタファイルに変換することができない、ちょっと残念な仕様です。

『基盤地図情報（縮尺レベル25000）の標高点（数値標高モデルを除く）』を使ってもよいのですが、数値標高モデルの方が必要な分だけダウンロードできてお手軽です。

参考：地図センターでは、基盤地図情報（数値標高モデル）変換サービスというものを１メッシュあたり280円で行っているようです。上手いというか、何というか・・・。

そのため、ESRIで公開している基盤地図情報変換ツールを使う必要があります。

以下、ダウンロード＆インストール方法。

1. JPGIS2.0形式の数値標高データをダウンロード（GML形式は未対応）
2. ESRIのホームページよりファイルをダウンロード
3. BMapConvInstaller.zipを適当な場所に解凍し、フォルダ内のSetup.exeを実行してインストール。
4. ArcMapかArcCatalogを起動し、[ツール] メニューの [カスタマイズ] をクリック。
5. [コマンド] タブをクリックし、[Japan Utilities] カテゴリの [コマンド] 一覧に「基盤地図情報変換ツール」コマンドが表示される。
6. [コマンド] リストから「基盤地図情報変換ツール」コマンドをドラッグして、任意のツールバーにドロップ。

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●基盤地図情報より無償でダウンロード可能な主なデータ

50mメッシュ標高（今後無くなるとのこと）
10mメッシュ標高
海岸線
軌道の中心線
建築物の外周線
行政区画の境界線及び代表点
水涯線
測量の基準点
道路縁
10m間隔の等高線

●データのダウンロード方法

1. データ提供サイトを開きます。
   http://fgd.gsi.go.jp/download/
2. JPGIS2.0形式とJPGIS2.0(GML)形式が公開されていますが、迷わずJPGIS2.0形式を選びましょう。GML形式は変換できません。
3. 必要とする地区および情報を選んで、ダウンロード
   ダウンロードしたファイルは、この時点で解凍する必要はありません。

●データの変換

ArcGIS9.2および9.3では、JPGIS形式のファイルを直接ArcGISで読み込むことは出来ません。
そこで、国土地理院が公開している『基盤地図情報閲覧コンバートソフト』によって、基盤地図情報をshapeファイルに変換します。

1. データのダウンロードと同じく、http://fgd.gsi.go.jp/download/ より、基盤地図情報閲覧コンバートソフトをダウンロードします。
2. 落としたzipファイルを解凍し、FGDV.exeを起動します。
3. コンバーターのメニューより、ファイル＞開く＞ダウンロードしたファイルを指定
4. 画面が更新されたら、メニューより、コンバート＞シェープファイルに変換
   ArcGIS9.3より、拡張DMの処理がしやすくなったらしいので、シェイプファイルではなくdmファイルに変換しても良いかもしれませんね。

●データの精度
基盤地図情報で公開されているデータは、２万５千分の１地形図がベースになっており、詳細な設計などには使えませんので注意が必要です。

http://www.gsi.go.jp/kiban/towa.html#k4　より
平面位置の誤差が、都市計画区域（都市計画法 （昭和４３年法律第１００号）第４条第２項に規定する都市計画区域をいう。以下この号において同じ。）内にあっては ２.５メートル以内、都市計画区域外にあって２５メートル以内であること。
高さの誤差が、都市計画区域内にあっては１.０メートル以内、都市計画区域外にあっては５.０メートル以内であること。

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